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- Chimie/Chimie analytique62
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire15
- Informatique [cs]/Bio-informatique [q-bio.QM]13
- Sciences du Vivant [q-bio]/Ingénierie biomédicale8
- Chimie/Chimie théorique et/ou physique7
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Biochimie [q-bio.BM]6
- Sciences du Vivant [q-bio]/Cancer6
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]4
- Chimie/Chemo-informatique3
- Chimie/Matériaux3
- Chimie/Polymères3
- Chimie3
- Informatique [cs]/Algorithme et structure de données [cs.DS]2
- Informatique [cs]/Traitement du signal et de l'image [eess.SP]2
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Biophysique2
- Sciences du Vivant [q-bio]/Ingénierie biomédicale/Imagerie2
- Sciences du Vivant [q-bio]/Sciences pharmaceutiques2
- Sciences du Vivant [q-bio]2
- Sciences de l'ingénieur [physics]/Traitement du signal et de l'image [eess.SP]2
- Chimie/Chimie inorganique1
- Chimie/Radiochimie1
- Informatique [cs]/Biotechnologie1
- Informatique [cs]/Complexité [cs.CC]1
- Informatique [cs]/Base de données [cs.DB]1
- Informatique [cs]/Traitement des images [eess.IV]1
- Mathématiques [math]/Analyse numérique [math.NA]1
- Physique [physics]/Matière Condensée [cond-mat]/Science des matériaux [cond-mat.mtrl-sci]1
- Physique [physics]/Physique [physics]/Chimie-Physique [physics.chem-ph]1
- Physique [physics]/Physique [physics]/Analyse de données, Statistiques et Probabilités [physics.data-an]1
- Physique [physics]/Physique [physics]/Instrumentations et Détecteurs [physics.ins-det]1
- Physique [physics]/Physique [physics]/Optique [physics.optics]1
- Physique [physics]1
- Sciences de l'environnement/Ingénierie de l'environnement1
- Sciences de l'environnement1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie animale1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Biologie moléculaire1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Biologie structurale [q-bio.BM]1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale/Botanique1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Ingénierie des aliments1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Immunologie1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Microbiologie et Parasitologie/Bactériologie1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Neurosciences [q-bio.NC]1
- Sciences du Vivant [q-bio]/Toxicologie/Ecotoxicologie1
- Sciences de l'Homme et Société/Archéologie et Préhistoire1
- Sciences de l'Homme et Société/Art et histoire de l'art1
- Sciences de l'ingénieur [physics]/Génie des procédés1
- Statistiques [stat]/Méthodologie [stat.ME]1
Mots-clefs
Auteurs
Fournier I.10
Lemaire R.9
Salzet M.8
Wisztorski M.5
Day R.4
Brunelle Alain4
Dugourd Philippe4
Chirot Fabien4
Ait-Menguellet S.3
C. Tabet J.3
Desmons A.3
Prideaux Brendan3
Stauber J.3
Fildier Aurélie3
Carré Vincent3
Schmitz-Afonso Isabelle3
Afonso Carlos3
Chatti Saber3
Fu Tingting3
Both Jean-Pierre2
Choi Chang Min2
Deschamps Estelle2
Heeren Ron2
Jardin-Mathé O.2
Kanicky Viktor2
Kricheldorf Hans R.2
Le Maître Johann2
Lemaur Vincent2
Mghirbi Salma2
P. Lucot J.2
Picaud Vincent2
Rudaz Serge2
Rusconi Filippo2
Saadaoui Asma2
Spengler Bernhard2
Stoeckli Markus2
Vinatier D.2
Raffin Guy2
Rogniaux Hélène2
Mounicou Sandra2
Daniel Régis2
Jacob Daniel2
Delépine-Gilon Nicole2
Dé Emmanuelle2
Alexandre Stephane2
Schaumann Annick2
Touboul David2
Loutelier-Bourhis Corinne2
Desbenoit Nicolas2
Pineau Charles2
Antoine Rodolphe2
Delsuc Marc-André2
Aubriet Frédéric2
Prim Damien2
Marque Sylvain2
Cornil Jérôme2
Salzet M.2
Medimagh Raouf2
Abdalla Soliman1
Alexandrov T1
Amusant Nadine1
Anger-Leroy M.1
Armstrong Daniel W1
Ayed Naceur1
B. Hendra J.1
Badoud Flavia1
Bahabri Fatima1
Ballivian Renaud1
Barknowitz Gitte1
Becker Loic1
Bellon S.1
Bellon Sophie1
Ben Abderrazak Hana1
Ben Rhomdhane Hatem1
Bergmann Sven1
Berkenkamp S.1
Blanc Landry1
Blinet Patrick1
Boccard Julien1
Botzanowski Thomas1
Bradbury James1
Brunelle A1
Brunet Didier-Luc1
Buchmann W.1
Caprioli Richard M.1
Capuccini Marco1
Caron Christophe1
Cascante Marta1
Charrier Jean-Philippe1
Colsch Benoit A1
Costa Jean1
Coulembier Olivier1
Cros-Perrial Emeline1
Daly Steven1
Delage Ludovic1
Della-Negra Serge1
Deschamps M.1
Dodbiba Edra1
Donard Ariane1
Dorrestein P C1
Dreolin Nicola1
Dubois P1
Ducoroy P.1
Duez Q1
Dutruch Lionel1
D’atri Valentina1
Ebbels Timothy M. D.1
Esposito Mélissa1
Fanuel Mathieu1
Far Johann1
Ferey Justine1
Fiamoncini Jarlei1
Fisher Gregory L.1
Foguet Carles1
Foucat Loïc1
Frydman Chiraz1
Ganash Aisha1
Garcia-Perez Manuel1
Genta-Jouve Grégory1
Gerbaux P.1
Gerbaux Pascal1
Gil-De-La-Fuente A.1
Giremus Audrey1
Glen Robert1
Goulitquer Sophie1
Grata Elia1
Greiner R.1
Grélard Florent1
Guenther Detlef1
Guevara Victor1
Guillarme Davy1
Guillonneau F.1
Günther Ulrich L.1
Haan Serge1
Halper Matthias1
Hamm Gregory1
Handakas Evangelos1
Haug Kenneth1
Heeren Ron M.A.1
Herman Stephanie1
Hernández-Mesa Maykel1
Hester Alfons1
Hohenester Ulli A1
Holub Petr1
Honing Maarten1
Hrdlicka Ales1
Hubert A.1
Hutchinson R.1
Izzo Massimiliano1
Jaber Ali1
Jean Géraldine1
Johnson David1
Jordens Jan1
Josse T.1
Junot Christophe A1
Kale Namrata1
Karaman Ibrahim1
Khalili Bita1
Khonsari Payam Emami1
Klinkert Ivo1
Knight Geoffrey1
Knight R.1
Kulesza Alexander1
Kultima Kim1
Kune Christopher1
Lam Yuko1
Lampa Samuel1
Landi Marion1
Lantéri Pierre1
Larroque Marion1
Lavigne Régis1
Ludwig Christian1
Lysiak Albane1
Malherbe Julien1
Martin Jean-Francois1
Massonnet Philippe1
Mazerolles Gérard1
Mengerink Ynze1
Mercier Frédéric1
Monsoor Misharl1
Monteau Fabrice1
Muller Jean-François1
Musso Johana1
Neumann Steffen1
Nothias L F1
Nothias-Scaglia Louis-Félix1
Novella Jon Ander1
O'Donovan Claire1
Otruba Vitezslav1
Ouertani Samia1
O’connor Peter1
Paolini Julien1
Pearce Jake T. M.1
Peluso Alina1
Perera Sirantha1
Peters Kristian1
Pezzatti Julian1
Piras Marco Enrico1
Pireddu Luca1
Pohlentz G.1
Auteurs de la structure
Revues
- Analytical Chemistry7
- Analytical and Bioanalytical Chemistry3
- BMC Bioinformatics3
- Journal of Analytical Atomic Spectrometry2
- Journal of Chromatography A2
- Rapid Communications in Mass Spectrometry2
- Bioinformatics2
- ChemSusChem1
- Biochimica et Biophysica Acta:Biomembranes1
- Chemical Papers1
- Chemistry - A European Journal1
- Comptes Rendus. Chimie1
- Current Protein and Peptide Science1
- Pure and Applied Chemistry1
- American Journal of Analytical Chemistry1
- Journal of Cheminformatics1
- European Journal of Mass Spectrometry1
- European Polymer Journal1
- Forensic Science International1
- Aims Environmental Science1
- Journal of Mass Spectrometry1
- Journal of Polymer Research1
- Journal of Proteome Research1
- Journal of The American Society for Mass Spectrometry1
- Microchemical Journal1
- Molecular and Cellular Proteomics1
- Physical Chemistry Chemical Physics1
- Talanta1
- Neuroendocrinology Letters1
- Médecine/Sciences1
- European Biophysics Journal1
- Analytica Chimica Acta1
- Spectra Analyse1
- BMC Genomics1
- Chemical Science1
- J. Proteome Res.1
- Journal of Proteomics1
- Bioresources1
- GigaScience1
- Phytochemistry1
- Scientific Reports1
- Frontiers in Chemistry1
Année de production
Institutions
- Institut de Chimie - CNRS Chimie45
- Université Claude Bernard Lyon 115
- Université de Lille, Sciences et Technologies11
- Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement10
- Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale9
- Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives8
- Université de Pau et des Pays de l'Adour7
- Université Paris-Saclay7
- Université Pierre et Marie Curie - Paris 67
- Institut National de la Recherche Agronomique6
- Université Toulouse III - Paul Sabatier5
- Université de Bordeaux5
- MetaboHUB5
- Université de Strasbourg4
- École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen4
- Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS4
- Université Le Havre Normandie4
- Université de Rouen Normandie4
- Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie4
- Université de Lorraine4
- Institut National Polytechnique (Toulouse)4
- Université de Caen Normandie4
- Université Paris-Sud - Paris 114
- Institut National de Recherche et d'Analyse Physico-Chimique3
- Université d'Évry-Val-d'Essonne3
- sherbrooke3
- IMT Atlantique3
- FOM Institute for Atomic and Molecular Physics3
- Université d'Angers3
- Université Sciences et Technologies - Bordeaux 13
- Université de Rennes2
- École Centrale de Nantes2
- Novartis Pharma AG2
- Université de Genève = University of Geneva2
- Université de Mons | University of Mons2
- Université de Cergy Pontoise2
- École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux2
- Universität Hamburg2
- Université Paris Descartes - Paris 52
- VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement2
- Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University2
- École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP]2
- École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique2
- Washington State University2
- HORIBA Scientific [France]2
- Université de Lille, Droit et Santé2
- Université de Montpellier2
- Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]2
- Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes2
- Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines2
- Université de Nantes2
- Université de Lausanne = University of Lausanne2
- Università degli Studi di Siena = University of Siena1
- Météo-France1
- Hackensack Meridian Health1
- Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier1
- Université Toulouse - Jean Jaurès1
- Institut National des Sciences Appliquées - Rennes1
- AgroParisTech1
- Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence1
- Vanderbilt University [Nashville]1
- Université de Bretagne Sud1
- Dartmouth College [Hanover]1
- Centre Léon Bérard [Lyon]1
- Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar1
- University of Cambridge [UK]1
- École normale supérieure - Rennes1
- Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique1
- Institut Pasteur [Paris]1
- Institut national des sciences de l'Univers1
- Cancéropôle du Grand Est1
- Université de Technologie de Belfort-Montbeliard1
- Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I1
- Université Pascal Paoli1
- Université de Bourgogne1
- Université de Brest1
- Université Louis Pasteur - Strasbourg I1
- Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques1
- BIOMERIEUX1
- IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC1
- University of California [San Diego]1
- Université de Mons-Hainaut1
- Ecole Nationale d'Ingénieurs de Tunis1
- Institut national de recherches archéologiques préventives1
- Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris)1
- Clermont Université1
- Institut Polytechnique de Bordeaux1
- University of Oxford1
- Lomonosov Moscow State University1
- European Molecular Biology Laboratory [Heidelberg]1
- Leibniz Institute of Plant Biochemistry1
- Centre National d'Études Spatiales [Toulouse]1
- University of Texas at Arlington [Arlington]1
- Instituto de Salud Carlos III [Madrid]1
- Massachusetts General Hospital [Boston]1
- Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna1
- Münster1
- Sequenom1
- Institute of Analytical Chemistry1
- Waters Corporation1
- Plateforme Génomique Santé Biogenouest®1
- Brandenburg University of Applied Sciences1
- Centre Hospitalier Universitaire Vaudois = Lausanne University Hospital [Lausanne]1
- Institut régional de Cancérologie de Montpellier1
- Life Sciences1
- Universidad Ceu San Pablo1
- Ultra Traces Analyses Aquitaine1
- Faculty of Pharmaceutical Sciences1
- Mass Spectrometry Department1
- Akzo Nobel1
- Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL]1
- European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute1
- Brunel University London [Uxbridge]1
- San Jose State University [San Jose]1
- Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie [Tunis]1
- German Centre for Integrative Biodiversity Research1
- CentraleSupélec1
- University of Birmingham1
- Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 121
- University of Birmingham [Birmingham]1
- Université Clermont Auvergne [2017-2020]1
- King Abdulaziz University1
- Eurogentec S.A. [Seraing, Belgique]1
- Université Montpellier 11
- Plateforme d'Analyse Protéomique de Paris Sud Ouest1
- Université de Franche-Comté1
- West Virginia University [Morgantown]1
- Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier1
- Leopold Franzens Universität Innsbruck - University of Innsbruck1
- CRS4 Bioinformat1
- Uppsala University1
- Netherlands Metabolomics Centre1
- Faculty of Science and Technology, Biochemistry and Molecular Biology1
- DSM Resolve1
- European research infrastructure for biobanking1
- Power Computing & Communication UvA B.V.1
- University of Texas Medical Branch at Galveston1
- Alberta Innovates – Technology Future1
- Advanced Mining Technology Center1
- Université Paris Cité1
- Physical electronics1
- Institut de Recherche pour le Développement1
- Imperial College London1
- Universidade de São Paulo = University of São Paulo1
- Maastricht University [Maastricht]1
- Belgian Institute for Space Aeronomy | Institut d'Aéronomie Spatiale de Belgique1
- Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 21
- Université de Liège1
- University of Alberta1
- École des hautes études en sciences sociales1
Laboratoires
Départements
Équipes de recherche
74 documents
Articles dans une revue55 document
- Michael Tuck, Florent Grélard, Landry Blanc, Nicolas Desbenoit. MALDI-MSI Towards Multimodal Imaging: Challenges and Perspectives. Frontiers in Chemistry, 2022, 10, ⟨10.3389/fchem.2022.904688⟩. ⟨hal-03811728⟩
- Justine Ferey, Marion Larroque, Isabelle Schmitz-Afonso, Johann Le Maître, Olivia Sgarbura, et al.. Imaging Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry of oxaliplatin derivatives in human tissue sections. Talanta, 2022, 237, pp.122915. ⟨10.1016/j.talanta.2021.122915⟩. ⟨hal-03400641⟩
- Landry Blanc, Gino Ferraro, Michael Tuck, Brendan Prideaux, Véronique Dartois, et al.. Kendrick Mass Defect Variation to Decipher Isotopic Labeling in Brain Metastases Studied by Mass Spectrometry Imaging. Analytical Chemistry, 2021, 93 (49), pp.16314-16319. ⟨10.1021/acs.analchem.1c03916⟩. ⟨hal-03687721⟩
- Albane Lysiak, Guillaume Fertin, Géraldine Jean, Dominique Tessier. Evaluation of open search methods based on theoretical mass spectra comparison. BMC Bioinformatics, 2021, 22 (2 (Special Issue)), pp.65. ⟨10.1186/s12859-021-03963-6⟩. ⟨hal-03318623⟩
- Florent Grélard, David Legland, Mathieu Fanuel, Bastien Arnaud, Loïc Foucat, et al.. Esmraldi: efficient methods for the fusion of mass spectrometry and magnetic resonance images. BMC Bioinformatics, 2021, 22 (1), pp.1-17. ⟨10.1186/s12859-020-03954-z⟩. ⟨hal-03150157⟩
- Filippo Rusconi. Free Open Source Software for Protein and Peptide Mass Spectrometry-based Science. Current Protein and Peptide Science, 2021, 22 (2), pp.134-147. ⟨10.2174/1389203722666210118160946⟩. ⟨hal-03160541⟩
- Estelle Deschamps, Annick Schaumann, Isabelle Schmitz-Afonso, Carlos Afonso, Emmanuelle Dé, et al.. Membrane phospholipid composition of Pseudomonas aeruginosa grown in a cystic fibrosis mucus-mimicking medium. Biochimica et Biophysica Acta:Biomembranes, 2021, 1863 (1), pp.183482. ⟨10.1016/j.bbamem.2020.183482⟩. ⟨hal-03024926⟩
- Matthias Halper, Marc-André Delsuc, Kathrin Breuker, Maria A van Agthoven. Narrowband Modulation Two-Dimensional Mass Spectrometry and Label-Free Relative Quantification of Histone Peptides. Analytical Chemistry, 2020, 92 (20), pp.13945-13952. ⟨10.1021/acs.analchem.0c02843⟩. ⟨hal-03090931⟩
- Evan Terrell, Vincent Carré, Anthony Dufour, Frédéric Aubriet, Yann Le Brech, et al.. Contributions to lignomics: Stochastic generation of oligomeric lignin structures for interpretation of MALDI‐FT‐ICR‐MS results. ChemSusChem, 2020, 13 (17), pp.4428-4445. ⟨10.1002/cssc.202000239⟩. ⟨hal-02923103⟩
- Maykel Hernández-Mesa, Valentina D’atri, Gitte Barknowitz, Mathieu Fanuel, Julian Pezzatti, et al.. Interlaboratory and Interplatform Study of Steroids Collision Cross Section by Traveling Wave Ion Mobility Spectrometry. Analytical Chemistry, 2020, 92 (7), pp.5013-5022. ⟨10.1021/acs.analchem.9b05247⟩. ⟨hal-03191081⟩
- Estelle Deschamps, Isabelle Schmitz-Afonso, Annick Schaumann, Emmanuelle Dé, Corinne Loutelier-Bourhis, et al.. Determination of the collision cross sections of cardiolipins and phospholipids from Pseudomonas aeruginosa by traveling wave ion mobility spectrometry-mass spectrometry using a novel correction strategy. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2019, 411 (30), pp.8123-8131. ⟨10.1007/s00216-019-02194-2⟩. ⟨hal-02380002⟩
- Mylène Ghislain, Nathalie Costarramone, Thierry Pigot, Marine Reyrolle, Sylvie Lacombe-Lhoste, et al.. High frequency air monitoring by selected ion flow tube-mass spectrometry (SIFT-MS): influence of the matrix for simultaneous analysis of VOC, CO2, ozone and water. Microchemical Journal, 2019, 153, pp.104435. ⟨10.1016/j.microc.2019.104435⟩. ⟨hal-02372657⟩
- Filippo Rusconi. mineXpert : Biological Mass Spectrometry Data Visualization and Mining with Full JavaScript Ability. Journal of Proteome Research, 2019, 18 (5), pp.2254-2259. ⟨10.1021/acs.jproteome.9b00099⟩. ⟨hal-02379614⟩
- Maria van Agthoven, Yuko Lam, Peter O’connor, Christian Rolando, Marc-André Delsuc. Two-dimensional mass spectrometry: new perspectives for tandem mass spectrometry. European Biophysics Journal, 2019, 48 (3), pp.213-229. ⟨10.1007/s00249-019-01348-5⟩. ⟨hal-03090908⟩
- Kristian Peters, James Bradbury, Sven Bergmann, Marco Capuccini, Marta Cascante, et al.. PhenoMeNal: processing and analysis of metabolomics data in the cloud. GigaScience, 2019, 8 (2), pp.giy149. ⟨10.1093/gigascience/giy149⟩. ⟨hal-02627233⟩
- Laetitia Guillot, Ludovic Delage, Alain Viari, Yves Vandenbrouck, Emmanuelle Com, et al.. Peptimapper: proteogenomics workflow for the expert annotation of eukaryotic genomes. BMC Genomics, 2019, 20 (1), pp.56. ⟨10.1186/s12864-019-5431-9⟩. ⟨hal-01987197⟩
- Y. Djoumbou-Feunang, Jarlei Fiamoncini, A. Gil-De-La-Fuente, R. Greiner, Claudine Manach, et al.. BioTransformer: a comprehensive computational tool for small molecule metabolism prediction and metabolite identification. Journal of Cheminformatics, 2019, 11, ⟨10.1186/s13321-018-0324-5⟩. ⟨hal-01997281⟩
- Tingting Fu, Emeline Houël, Nadine Amusant, David Touboul, Grégory Genta-Jouve, et al.. Biosynthetic investigation of $\gamma$-lactones in Sextonia rubra wood using in situ TOF-SIMS MS/MS imaging to localize and characterize biosynthetic intermediates. Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.1928. ⟨10.1038/s41598-018-37577-5⟩. ⟨hal-02066013⟩
- Vincent Picaud, Jean-François Giovannelli, Caroline Truntzer, Jean-Philippe Charrier, Audrey Giremus, et al.. Linear MALDI-ToF simultaneous spectrum deconvolution and baseline removal. BMC Bioinformatics, 2018, 19 (1), pp.123. ⟨10.1186/s12859-018-2116-3⟩. ⟨cea-01917788⟩
- Tingting Fu, Nicolas Elie, Alain Brunelle. Radial distribution of wood extractives in European larch Larix decidua by TOF-SIMS imaging. Phytochemistry, 2018, 150, pp.31-39. ⟨10.1016/j.phytochem.2018.02.017⟩. ⟨hal-02111695⟩
- Jean Haler, Philippe Massonnet, Fabien Chirot, Christopher Kune, Clothilde Comby-Zerbino, et al.. Comparison of Different Ion Mobility Setups Using Poly (Ethylene Oxide) PEO Polymers: Drift Tube, TIMS, and T-Wave. Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2018, 29 (1), pp.114-120. ⟨10.1007/s13361-017-1822-9⟩. ⟨hal-01704016⟩
- Germán Velásquez, Anastassia Y. Borisova, Sandrine Baron, Luc Robbiola. In Situ Analysis of Copper Alloys by Femtosecond Laser Ablation Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry: Constrains on Matrix Effects. American Journal of Analytical Chemistry, 2018, 9 (3), pp.150-161. ⟨10.4236/ajac.2018.93013⟩. ⟨hal-02010519⟩
- Alexis Delabrière, Ulli A Hohenester, Benoit A Colsch, Christophe A Junot, François A Fenaille, et al.. proFIA: A data preprocessing workflow for Flow Injection Analysis coupled to High-Resolution Mass Spectrometry. Bioinformatics, 2017, 33 (23), pp.3767-3775. ⟨10.1093/bioinformatics/btx458⟩. ⟨hal-01574347⟩
- Q Duez, T. Josse, Vincent Lemaur, Fabien Chirot, Chang Min Choi, et al.. Correlation between the shape of the ion mobility signals and the stepwise folding process of polylactide ions. Journal of Mass Spectrometry, 2017, 52 (3), pp.133-138. ⟨10.1002/jms.3915⟩. ⟨hal-01518997⟩
- Ariane Donard, F. Pointurier, A.-C. Pottin, A. Hubert, Christophe Pécheyran. Determination of the isotopic composition of micrometric uranium particles by UV femtosecond laser ablation coupled with sector-field single-collector ICP-MS.. Journal of Analytical Atomic Spectrometry, 2017, 32, pp.96-106. ⟨10.1039/C6JA00071A⟩. ⟨hal-01481299⟩
- Mélanie Lagarrigue, Richard M. Caprioli, Charles Pineau. Potential of MALDI imaging for the toxicological evaluation of environmental pollutants. Journal of Proteomics, 2016, 144, pp.133--139. ⟨10.1016/j.jprot.2016.05.008⟩. ⟨hal-01367141⟩
- Louis-Félix Nothias-Scaglia, Mélissa Esposito, Jean Costa, Julien Paolini, David Touboul, et al.. Les réseaux moléculaires, une approche bio-informatique globale pour interpréter les données de spectrométrie de masse tandem. Spectra Analyse, 2015, 307, pp.73-78. ⟨hal-01254171⟩
- Christelle Machon, Claire Bordes, Emeline Cros-Perrial, Yohann Clément, Lars Petter Jordheim, et al.. Use of designed experiments for the improvement of pre-analytical workflow for the quantification of intracellular nucleotides in cultured cell lines. Journal of Chromatography A, 2015, 1405, pp.116-125. ⟨10.1016/j.chroma.2015.05.069⟩. ⟨hal-01186720⟩
- Franck Giacomoni, Gildas Le Corguillé, Misharl Monsoor, Marion Landi, Pierre Pericard, et al.. Workflow4Metabolomics: A collaborative research infrastructure for computational metabolomics. Bioinformatics, 2015, 31 (9), pp.1493-1495. ⟨10.1093/bioinformatics/btu813⟩. ⟨hal-01123263⟩
- Christelle Planche, Jérémy Ratel, Frédéric Mercier, Patrick Blinet, Laurent Debrauwer, et al.. Assessment of comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry based methods for investigating 206 dioxin-like micropollutants in animal-derived food matrices. Journal of Chromatography A, 2015, 1392, pp.74-81. ⟨10.1016/j.chroma.2015.02.054⟩. ⟨hal-03696520⟩
- Andreas Römpp, Jean-Pierre Both, Alain Brunelle, Ron Heeren, Olivier Laprévote, et al.. Mass spectrometry imaging of biological tissue: an approach for multicenter studies. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2015, 407 (8), pp.2329 - 2335. ⟨10.1007/s00216-014-8410-7⟩. ⟨hal-01864902⟩
- Johana Musso, William Buchmann, Florence Gonnet, Nathalie Jarroux, Sophie Bellon, et al.. Biomarkers probed in saliva by surface plasmon resonance imaging coupled to matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry in array format. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2015, 407 (5), pp.1285-1294. ⟨10.1007/s00216-014-8373-8⟩. ⟨hal-01966798⟩
- Vincent Carré, Sébastien Schramm, Frédéric Aubriet. Study of a complex environmental mixture by electrospray ionization and laser desorption ionization high resolution mass spectrometry: the cigarette smoke aerosol. Aims Environmental Science, 2015, 2 (3), pp.547-564. ⟨10.3934/environsci.2015.3.547⟩. ⟨hal-02528927⟩
- Steven Daly, Alexander Kulesza, F Poussigue, Anne-Laure Simon, Chang Min Choi, et al.. Conformational changes in Amyloid-Beta (12-28) alloforms studied using action-FRET, IMS and molecular dynamics simulations. Chemical Science, 2015, 6 (8), pp.5040-5047. ⟨10.1039/C5SC01463H⟩. ⟨hal-01344545⟩
- Marie-France Robbe, Jean-Pierre Both, Brendan Prideaux, Ivo Klinkert, Vincent Picaud, et al.. Software tools of the Computis European project to process mass spectrometry images. European Journal of Mass Spectrometry, 2014, 20 (5), pp.351 - 360. ⟨10.1255/ejms.1293⟩. ⟨cea-01669226⟩
- Jean-Yves Salpin, Luke Macaleese, Fabien Chirot, Philippe Dugourd. Structure of Pb2+-deprotonated dGMP complexes in the gas phase: a combined MS-MS/IRMPD spectroscopy/Ion Mobility study. Physical Chemistry Chemical Physics, 2014, 16 (27), pp.14127-14138. ⟨10.1039/C4CP00163J⟩. ⟨hal-01345026⟩
- Raouf Medimagh, Asma Saadaoui, Salma Mghirbi, Sylvain Marque, Damien Prim, et al.. New biosourced alternated poly(ether)Ester-Amides (PeEA): synthesis and combined NMR/MALDI ToF MS characterization. Journal of Polymer Research, 2014, 21 (6), pp.article 486. ⟨10.1007/s10965-014-0486-4⟩. ⟨hal-01057926⟩
- Soliman Abdalla, Antonio Pizzi, Naceur Ayed, Fatima Charrier-El Bouhtoury, Bertrand Charrier, et al.. MALDI-TOF Analysis of Aleppo Pine (Pinus halepensis) Bark Tannin. Bioresources, 2014, 9 (2), pp.3396-3406. ⟨10.15376/biores.9.2.3396-3406⟩. ⟨hal-01560509⟩
- Raouf Medimagh, Salma Mghirbi, Asma Saadaoui, Aurélie Fildier, Marlène Desloir-Bonjour, et al.. Synthesis of biosourced polyether-amides from 1,4-3,6-dianhydrohexitols: Characterization by NMR and MALDI-ToF mass spectrometry. Comptes Rendus. Chimie, 2013, 16 (12), pp.1127-1139. ⟨10.1016/j.crci.2013.05.004⟩. ⟨hal-00905733⟩
- Loic Becker, Anne Poutaraud, Gregory Hamm, Jean-François Muller, Didier Merdinoglu, et al.. Metabolic study of grapevine leaves infected by downy mildew using negative ion electrospray - Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry. Analytica Chimica Acta, 2013, 795, pp.44-51. ⟨10.1016/j.aca.2013.07.068⟩. ⟨hal-01518906⟩
- Sirantha Perera, Alain Berthod, Edra Dodbiba, Daniel W Armstrong. Coupling solid-phase microextraction and laser desorption ionization for rapid identification of biological material.. Rapid Communications in Mass Spectrometry, 2012, 26 (7), pp.853-862. ⟨10.1002/rcm.6168⟩. ⟨hal-00877227⟩
- Linda Zaoralkova, Ales Hrdlicka, Vitezslav Otruba, Petr Sulovsky, Nicole Delépine-Gilon, et al.. Investigation of multi-layered silicate ceramics using laser ablation optical emission spectrometry, laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry, and electron microprobe analysis. Chemical Papers, 2011, 65 (6), pp.769-781. ⟨10.2478/s11696-011-0085-3⟩. ⟨hal-00876011⟩
- Julien Boccard, Flavia Badoud, Elia Grata, Samia Ouertani, Mohamed Hanafi, et al.. A steroidomic approach for biomarkers discovery in doping control.. Forensic Science International, 2011, 213 (1-3), pp.85-94. ⟨10.1016/j.forsciint.2011.07.023⟩. ⟨hal-00877464⟩
- Hana Ben Abderrazak, Aurélie Fildier, Sylvain Marque, Damien Prim, Hatem Ben Rhomdhane, et al.. Cyclic and non cyclic aliphatic-aromatic polyesters derived from biomass: Study of structures by MALDI-ToF and NMR. European Polymer Journal, 2011, 47 (11), pp.2097-2110. ⟨10.1016/j.eurpolymj.2011.07.009⟩. ⟨hal-00639329⟩
- Julien de Winter, Vincent Lemaur, Renaud Ballivian, Fabien Chirot, Olivier Coulembier, et al.. Size dependence of the folding of multiply charged sodium cationized polylactides revealed by ion mobility mass spectrometry and molecular modelling. Chemistry - A European Journal, 2011, 17 (35), pp.9738-9745. ⟨10.1002/chem.201100383⟩. ⟨hal-00875409⟩
- Junkan Song, Antony Memboeuf, Ron Heeren, Károly Vékey, Oscar F van den Brink. Discrimination between charge-catalyzed and charge-independent fragmentation processes of cationized poly(n-butyl acrylate).. Rapid Communications in Mass Spectrometry, 2010, 24 (21), pp.3214-6. ⟨10.1002/rcm.4764⟩. ⟨hal-00718091⟩
- S. Bellon, W. Buchmann, F. Gonnet, N. Jarroux, M. Anger-Leroy, et al.. Hyphenation of Surface Plasmon Resonance Imaging to Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry by On-Chip Mass Spectrometry and Tandem Mass Spectrometry Analysis. Analytical Chemistry, 2009, 81 (18), pp.7695-7702. ⟨10.1021/ac901140m⟩. ⟨hal-01967571⟩
- Sandra Mounicou, Ryszard Lobinski. Challenges to metallomics and analytical chemistry solutions. Pure and Applied Chemistry, 2008, 80 (12), pp.2565--2575. ⟨10.1351/pac200880122565⟩. ⟨hal-01560760⟩
- R. Lemaire, A. Desmons, J. C. Tabet, R. Day, M. Salzet, et al.. Direct Analysis and MALDI Imaging of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Tissue Sections. J. Proteome Res., 2007, 6 (4), pp.1295 -1305. ⟨10.1021/pr060549i⟩. ⟨hal-00167250⟩
- Klaus Dreisewerd, R. Lemaire, G. Pohlentz, M. Salzet, M. Wisztorski, et al.. Molecular profiling of matrix coated and native tissue sections by UV and IR MALDI-O-TOF-MS.. Analytical Chemistry, 2007, 79 (6), pp.2463 -2471. ⟨10.1021/ac061768q⟩. ⟨hal-00086947⟩
- M. Wisztorski, R. Lemaire, J. Stauber, S. Ait-Menguellet, O. Jardin-Mathé, et al.. MALDI imaging: a new technology to discover and validate new biomarkers. Médecine/Sciences, 2007, 23 (1), pp.31-36. ⟨hal-00086943⟩
- R. Lemaire, M. Wisztorski, A. Desmons, J. C. Tabet, R. Day, et al.. MALDI-MS Direct Tissue Analysis of Proteins: Improving Signal Sensitivity Using Organic Treatments. Analytical Chemistry, 2006, 78 (20), pp.7145 -7153. ⟨10.1021/ac060565z⟩. ⟨hal-00086901⟩
- R. Lemaire, J. C. Tabet, P. Ducoroy, J. B. Hendra, M. Salzet, et al.. Solid ionic matrices for direct tissue analysis and MALDI imaging.. Analytical Chemistry, 2006, 78 (3), pp.809 -819. ⟨10.1021/ac0514669⟩. ⟨hal-00086905⟩
- J. Stauber, R. Lemaire, M. Wisztorski, S. Ait-Menguellet, J. P. Lucot, et al.. Direct profiling and MALDI Imaging in clinical proteomic. Molecular and Cellular Proteomics, 2006, 5 (10), pp.S247-S247. ⟨hal-00086942⟩
- I. Fournier, R. Day, M. Salzet. Direct Analyses of neuropeptides by in situ MALDI-TOF mass spectrometry in the rat brain. Neuroendocrinology Letters, 2003, 1 (24), pp.9-14. ⟨hal-00167329⟩
Communications dans un congrès5 document
- Valérie Gabelica, Brian H Clowers, Stephen J Valentine. Ion Mobility Spectrometry: Towards Standard Operating Procedures (Ion Mobility MS Interest Group workshop report). 65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, ASMS, Jun 2017, Indianapolis, United States. ⟨hal-01557049⟩
- L F Nothias, Ivan Protsiuc, T Alexandrov, R. Knight, A Brunelle, et al.. 3D-Plant2cells project: Spatial metabolomic, spatial metagenomic, and 3D mass spectrometry imaging, to explore the impact of pesticides on plant metabolome and microbiota. 64th Annual Meeting of GA and 9th Joint Natural Product Conference 2016, ociety for Medicinal Plant and Natural Product Research (GA), the Phytochemical Society of Europe (PSE), Società Italiana di Fitochimica (SIF), Association Francophone pour l’Enseignement et la Recherche en Pharmacognosie (AFERP), and the Japanese Society of Pharmacognosy (JSP), Jul 2016, Copenhaguen, Denmark. pp.S1-S381, ⟨10.1055/s-0036-1596119⟩. ⟨hal-02060185⟩
- R. Lemaire, J. Stauber, M. Wisztorski, O. Jardin-Mathé, M. Salzet, et al.. MALDI DIRECT ANALYSIS AND IMAGING OF FROZEN VERSUS FFPE TISSUES: WHAT STRATEGY FOR WHICH SAMPLE?. 55th ASMS, Jun 2007, Indianapolis, United States. pp.0. ⟨hal-00167284⟩
- S. Ait-Menguellet, I. Fournier, R. Lemaire, J. P. Lucot, D. Vinatier, et al.. DIRECT PROFILING AND MALDI IMAGING OF TISSUES: NEW DEVELOPMENTS AND CLINICAL APPLICATIONS FOR OVARIAN CANCER. Clinical Proteomics in Oncology, 2006, Dijon, France. pp.10. ⟨hal-00167326⟩
- R. Day, I. Fournier, M. Salzet. Analyse directe de neuropeptides dans le cerveau de rat par spectrométrie de masse MALDI-TOF In Situ. Societé Française de Spectrométrie de masse, club jeune, 2002, Chaville, France. pp.0. ⟨hal-00167328⟩
N°spécial de revue/special issue1 document
- Alice Stankova, Nicole Delépine-Gilon, Lionel Dutruch, Viktor Kanicky. Comparison of LA-ICP-MS and LA-ICP-OES for the analysis of some elements in fly ashes. JAAS Symposium, Nov 2010, Beijing, China. Journal of Analytical Atomic Spectrometry, 26 (2), pp.443-449, 2011, ⟨10.1039/c0ja00020e⟩. ⟨hal-00981665⟩
Chapitres d'ouvrage3 document
- Sebastiaan van Nuffel, Alain Brunelle. TOF-SIMS Imaging of Biological Tissue Sections and Structural Determination Using Tandem MS. Young-Jin Lee. Mass Spectrometry Imaging of Small Molecules: Methods and Protocols, 2437, Springer US, pp.77-86, 2021, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-2029-8. ⟨10.1007/978-1-0716-2030-4_5⟩. ⟨hal-03479024⟩
- Fanny Claverie. Laser ablation. Sample Introduction Systems in ICPMS and ICPOES, Elsevier, pp.469-531, 2020, ⟨10.1016/B978-0-444-59482-2.00010-5⟩. ⟨hal-03176028⟩
- Dirk Schaumlöffel, R. Hutchinson, Julien Malherbe, Philippe Le Coustumer, E. Gontier, et al.. Novel Methods for Bioimaging Including LA-ICP-MS, NanoSIMS, TEM/X-EDS, and SXRF. Metallomics Analytical Techniques and Speciation Methods, Wiley-VCH Verlag, pp.83-116, 2016, 9783527694907 (ISBN); 9783527339693 (ISBN). ⟨hal-01529884⟩
Brevets1 document
- R. Lemaire, I. Fournier, M. Salzet, Jc. Tabet. USE OF IONIC MATRICES FOR MALDI MASS SPECTROMETRY ANALYSIS OF TISSUE SECTIONS. United States, Patent n° : WO2006IB02311 20060607. 2007, pp.43. ⟨hal-00167309⟩
Pré-publications, Documents de travail1 document
- Diogo Borges Lima, Mathieu Dupré, Magalie Duchateau, Quentin Giai Gianetto, Martial Jean-Pierre Rey, et al.. Using ProteoCombiner to integrate bottom-up and top-down proteomics data to improve proteoform identification. 2021. ⟨pasteur-03243560⟩
Thèses8 document
- Caroline Bouvier. Étude du vieillissement de peintures anciennes par imagerie par spectrométrie de masse 3D. Chimie analytique. Sorbonne Université, 2022. Français. ⟨NNT : 2022SORUS008⟩. ⟨tel-03593167⟩
- Johann Le Maître. Développement de la spectrométrie de masse à ultra- haute résolution associée à la spectrométrie de mobilité ionique pour la caractérisation de coupes pétrolières lourdes.. Chimie analytique. Normandie Université, 2020. Français. ⟨NNT : 2020NORMR051⟩. ⟨tel-03368776⟩
- Matthieu David. Découverte de modifications chimiques portées par les protéines : identification rapide de jeux de spectres de masse sans filtre de masse. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Bretagne-Loire, 2019. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02505167⟩
- Thomas Botzanowski. Nouvelles méthodologies en spectrométrie de masse native et mobilité ionique pour la caractérisation structurale de protéines d'intérêt thérapeutique et de complexes multiprotéiques. Chimie analytique. Université de Strasbourg, 2019. Français. ⟨NNT : 2019STRAF010⟩. ⟨tel-03270831⟩
- Tingting Fu. 3D and High Sensitivity Micrometric Mass Spectrometry Imaging. Analytical chemistry. Université Paris Saclay (COmUE), 2017. English. ⟨NNT : 2017SACLS218⟩. ⟨tel-01699065v2⟩
- Ali Jaber. Matrices MALDI bithiophéniques spécifiques aux alcaloïdes : étude des mécanismes fondamentaux et applications. Chimie analytique. Université d'Angers; Liban, 2017. Français. ⟨NNT : 2017ANGE0042⟩. ⟨tel-01798295⟩
- Quentin Vanbellingen. Imagerie de substances naturelles par spectrométrie de masse. Chimie analytique. Université Paris Saclay (COmUE), 2015. Français. ⟨NNT : 2015SACLS172⟩. ⟨tel-01278744⟩
- Kevin Vervier. Structured machine learning methods for microbiology : mass spectrometry and high-throughput sequencing. Bioinformatics [q-bio.QM]. Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2015. English. ⟨NNT : 2015ENMP0081⟩. ⟨tel-01336560⟩